| 초록 |
중금속 전사 ATP효소(heavy metal transporting ATPase, HMA)는 ATP를 가수분해하여 중금속 양이온을 막통과 수송하는 수송 단백질(transport protein)이며 P-ATPase 집단의 아부류(subclasses)에 속한다. 다양한 HMA 단백질이 중금속 이온에 대한 수송은 선택성이 있으며 식물로 중금속 오염 토양을 복원하는데서 중요한 작용을 한다. 포플러 나무(Populus trichocarpa)의 게놈 서열 측정 결과와 HMA 유전자 단백질의 서열과 기능 특징에 근거하여 포플러 나무 게놈에서 13개의 HMA 유전자 집단 구성 요소를 감정했는데, 모두 Zn 아부류(Zn 2+ /Co 2+ /Cd 2+ /Pb 2+ P 1B -ATPase)와 Cu 아부류(Cu + /Ag + P 1B -ATPase) 두 가지 아집단에 속하며 주로 1, 3호 염색체에 분포되어 있다. 생물정보학적 분석 결과, 포플러 나무 HMA 유전자의 아미노산 서열의 일치성은 21.3%~89.3%이며 보수적인 유저자 서열 CPC, HP, DKTGT, TGEx, GDG, PxD, CxxC 등을 갖고 있다. 단백질의 이화학적 특징을 분석한 결과, 대부분의 포플러 나무의 HMA 단백질은 산성에 더욱 가깝고, 구조가 비교적 안정적이며 단백질의 용해지수(Solubility index)가 높으며 소수성(Hydrophobic)을 갖고 있다. 코돈 선호도(Codon preference) 분석 결과, 포플러 나무 HMA 단백질의 14개 아미노산에 있는 16개의 코돈(High-frequency codon)과 한 가지 종결 코돈(termination codon)은 고주파 코돈으로서 포플러 나무의 종속 특징을 나타낸다. 이상의 연구 결과는 포플러 나무 HMA 유전자 집단의 기본 정보와 특징을 나타냈으며, 포플러 나무 HMA 유전자의 기능에 대하여 심층 연구하는데 기초 플랫폼을 구축하였다. |
