초록 |
목적: 생물 정보학적 방법을 이용하여 노랑 초파리의 CG18853 유전자 코딩 단백질의 구조와 기능을 분석한다. 방법: NCBI 데이터 베이스중 노랑 초파리 CG18853 유전자 코딩 단백질의 아미노산 서열을 기반으로, 단백질의 물리화학적 특성, 막관통영역, 신호 펩티드, 아세포 위치 확정, 도메인, 삼차원 구조 및 서로 다른 종(species)사이의 동족 단백질의 진화관계를 분석한다. 결과: 초파리 CGl8853 단백질의 이론적인 분자량은 약 38.5kDa이며, 이론적인 등전점은 8.80이었다. CGl8853 단백질은 불안정한 친수성 단백질이었고, 막관통영역과 신호 펩티드가 없었으며, DNA 포토리아제 FAD 결합구조 영역을 갖추고 있었다. 초파리 CGl8853 단백질과 템플릿 3umv.1.A의 아미노산 서열은 60.87% 일치하였으며, CGl8853 단백질과 캥거루쥐, 붕어, 애기장대, 일본형 벼의 코딩 생성물은 동족체일 확율이 아주 높았다. 결론: 노랑 초파리 CGl8853 단백질은 DNA포토리아제 패밀리 구조를 구비하고 있어, 세포핵속에서 DNA 손상 회복 과정에 참여할 가능성이 있다. |