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논문 기본정보

Bioinformatics Analysis and Verification of Common Genes in the Lung Cancer cDNA-libraries Constructed by Suppression Subtractive Hybridization

논문 개요

기관명, 저널명, ISSN, ISBN 으로 구성된 논문 개요 표입니다.
기관명 NDSL
저널명 中國生物化學與分子生物學報 = Chinese journal of biochemistry and molecular biology
ISSN 1007-7626,
ISBN

논문저자 및 소속기관 정보

저자, 소속기관, 출판인, 간행물 번호, 발행연도, 초록, 원문UR, 첨부파일 순으로 구성된 논문저자 및 소속기관 정보표입니다
저자(한글) WU, Ming-song,FAN, Meng-meng,MA, Zhan-shan,CAO, Yi
저자(영문)
소속기관
소속기관(영문)
출판인
간행물 번호
발행연도 2015-01-01
초록 억제성 감수잡종형성(suppression subtractive hybridization, SSH) 기술은 그 작업 과정이 간단하고 선별 효율이 높으며, 위양성률(False positive rate)이 낮은 등 장점이 있으므로 생물과 의학 분야에 많이 응용되고 있다. 본 논문에서는 SSH를 이용하여 구축한 10개 폐암 차등발현 유전자의 라이브러리(gene library)에서 반복되는 유전자를 탐색한다. 그 결과, 6개의 정(+) 방향 잡종 라이브러리에서 2번 나타난 유전자가 41개이고 3번 나타난 유전자가 4개였다; 4개 역(-) 방향 잡종 라이브러리에서는 2번 나타난 유전자가 6개였다. 생물 정보학을 이용하여 한층 더 분석한 결과, 이렇게 반복되는 차등발현 유전자(differential gene expression)는 유전자 전사, 단백질 번역, 세포 부착, DNA 복구, 산화 환원 반응 등 다양한 세포 기능에 참여하는 것으로 확인되었다. 주의할 것은 이런 차등발현 유전자에서 리보솜(ribosome) 단백질과 관련되는 유전자의 비율이 가장 높았다. 실시간 정량 PCR 기법으로 라이브러리의 TIMP3, GPX3, HSP90B1, CD9 등 유전자 발현을 검사하였다. 그 결과 SSH 라이브러리에서 차등발현 유전자의 상향 조절과 하향 조절 추세가 양호한 특이성이 있었다. 해당 연구는 폐암 관련 유전자의 발견에 유용한 실마리를 제공하였다.
원문URL http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART72307951
첨부파일

추가정보

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과학기술표준분류
ICT 기술분류
DDC 분류
주제어 (키워드) lung cancer,suppression subtractive hybridization,bioinformatics,gene library,폐암,억제성 감수잡종형성,생물 정보학,유전자 라이브러리