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논문 기본정보
Genome-wide analysis of miRNAs and target prediction in Chlamydomonas reinhardtii
논문 개요
| 기관명 | NDSL |
|---|---|
| 저널명 | 應用與環境生物學報 = Chinese journal of applied and environmental biology |
| ISSN | 1006-687x, |
| ISBN |
논문저자 및 소속기관 정보
| 저자(한글) | YUE, Jian-yu,FEI, Zhong-an,LANG, Xiao-qiang,XU, Hui,QIAO, Dai-rong,CAO, Yi |
|---|---|
| 저자(영문) | |
| 소속기관 | |
| 소속기관(영문) | |
| 출판인 | |
| 간행물 번호 | |
| 발행연도 | 2015-01-01 |
| 초록 | Chlamydomonas reinhardtii는 중요한 모델 생물이며, 그 miRNA는 비교적 늦게 발견되었다. Chlamydomonas reinhardtii의 miRNA를 체계적으로 예측 및 분석하기 위하여, 비교유전체학과 상동성 비교를 결합한 방법을 이용하고, miRbase에서 이미 알려진 Chlamydomonas reinhardtii miRNA 서열 및 전구체 특징에 근거하여, Chlamydomonas reinhardtii 전유전체를 기반으로 그 miRNA의 전구체 서열과 성숙 miRNA에 대해 계통적으로 분석하고 선별하였다. unigene과 JGI의 Chlamydomonas reinhardtii 관련 서열 데이터베이스를 이용하여 예측 결과에 대해 타겟 유전자 예측과 기능을 분석하였다. 최종 결과, 총 36개의 miRNA가 존재할 수 있으며, 그 전구체 구조는 miRNA 전구체의 기본 특성에 부합되고 높은 상동성을 갖고 있다. 2개 데이터베이스에서 얻은 일치한 타겟 유전자는 각각 64와 32개 있으며, 그중 일부분은 Chlamydomonas reinhardtii의 각 생명 활동과 관련되는 유전자이다. 결과적으로, Chlamydomonas reinhardtii의 유전체는 가능하게 존재하는 새로운 miRNA 패밀리를 갖고 있으며, 일부분에 있는 높은 일치성을 가진 타겟 유전자는 후속 연구에 신뢰적인 이론적 지원을 제공하였다. |
| 원문URL | http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART73115323 |
| 첨부파일 |
추가정보
| 과학기술표준분류 | |
|---|---|
| ICT 기술분류 | |
| DDC 분류 | |
| 주제어 (키워드) | Chlamydomonas reinhardtii,miRNA,genome-wide,comparative genomics,homologous comparison,target gene,bioinformatics,Chlamydomonas reinhardtii,miRNA,전유전체,비교유전체학,상동성 비교,타겟 유전자,생물정보학 |