| 초록 |
생물 정보학을 이용하여 그물버섯(Boletus edulis) 전유전체 내 SSR 위치를 통계 분석하고, 기타 3종 담자균 게놈(재먹물버섯, 치마버섯, 느타리버섯)과 비교하였다. 실험 결과, 그물버섯 게놈에 2,732개 SSR 위치가 있고 SSR 간의 평균 거리가 17.1kb인 것으로 확인되었다. 73.02%의 SSR 위치가 게놈의 비코딩 영역에 분포되었고 모노뉴클레오티드(mononucleotide)와 트리뉴클레오티드(Trinucleotide)의 반복 유형을 위주로 하였다. 5' 혹은 3' 비코딩 영역에 분포된 SSR의 상대 풍도가 가장 높고 86개/Mb인 것으로 확인되었다. 상대 풍도가 가장 낮은 것은 코딩 서열에 분포된 SSR 상대 퐁도로써, 31개/Mb이었다. 또한 고속 대량 선별을 통해 41개 긴 SSR 위치의 프라이머를 설계하고 e-PCR을 통해 감정하였다. 마지막으로 기타 3종 담자균 게놈과의 비교를 통해, SSR 수량과 게놈 크기 간에 관련이 없으며 SSR 유형이 모두 짧은 반복 유형(모노뉴클레오티드에서 트리뉴클레오티드)을 위주로 한다는 것을 발견하였다. 비교 분석을 통해 그물버섯 게놈 내 SSR 위치의 수량이 상대적으로 많고 밀도도 높은 것으로 확인되었다. |
