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논문 기본정보

Mitochondrial Gene Intron Sequences Analysis of Medicinal Parasitic Plant Cynomorium songaricum

논문 개요

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기관명 NDSL
저널명 基因組學與應用生物學 = Genomics and applied biology
ISSN 1674-568x,
ISBN

논문저자 및 소속기관 정보

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저자(한글) SU, Xiao-juan,LIU, Guang-da,LIU, Ying,FENG, Xiao-yu,CHEN, Gui-lin
저자(영문)
소속기관
소속기관(영문)
출판인
간행물 번호
발행연도 2015-01-01
초록 속씨식물 미토콘드리아 유전자 cox1 유전자의 Group I 인트론에는 수평적 유전자 이동(horizontal gene transfer, HGT) 형상이 흔히 발생한다. 본 연구에서는 약용 기생식물 쇄양(Cynomorium songaricum) 미토콘드리아 유전자 cox1, cox2 및 nad1의 서열을 증폭하고 분석하였으며, 최대 우도추정법을 사용하여 cox1과 cox2 유전자의 인트론과 엑손에 대한 군집 분석을 진행하였다. 분석 결과, cox1 인트론의 군집 결과는 기타 3개 군집 결과와 일치하지 않았는데, 이는 해당 인트론에 수평적 유전자 이동 형상이 존재하는 것을 입증한다. 또한, 쇄양의 6개 다양한 개체군 간에 미토콘드리아 유전자 cox1, cox2 및 nad1의 인트론과 엑손 서열 평균 거리를 비교한 결과, 6개의 다양한 개체군에 cox1 유전자 인트론의 상동성은 100%에 도달하였는데, 이는 해당 유전자 인트론이 기능을 가지고 있는 것을 설명한다. 생물정보학적 분석 결과, 해당 인트론이 엔도뉴클레아제(endonuclease)를 부호화할 가능성이 있다. DNA 엔도뉴클레아제는 인트론의 이동을 촉진시킬 수 있다. 3'Co-conversion tracts(3'CCT)는 속씨식물 인트론의 이동 흔적이다. 쇄양 cox1 유전자 서열에 대한 검사 결과, 이 유전자는 길이가 35 bp인 3'CCT 서열을 함유하였다. 또한, RT-PCR 실험 검증 결과를 통하여 cox1 유전자 인트론이 독립적으로 mRNA를 전사시킬 수 있는 것으로 나타났다. 결론적으로, 쇄양 cox1 유전자 인트론은 엔도뉴클레아제를 부호화할 가능성이 크며 엔도뉴클레아제는 인트론의 이동을 촉진시켰다.
원문URL http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART75847454
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과학기술표준분류
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주제어 (키워드) Mitochondrial gene,Introns,Horizontal gene transfer,Cynomorium songaricum,미토콘드리아 유전자,인트론,수평적 유전자 이동,서열 분석,쇄양