| 저자(한글) |
WANG, Peng-fei,WANG, Ying-fang,DUAN, Guang-cai,XUE, Ze-run,WANG, Lin-lin,GUO, Xiang-jiao,YANG, Hai-yan,XI, Yuan-lin |
| 초록 |
생물정보학 방법을 이용하여 시겔라균(Shigella)의 주기적으로 간격을 띠고 분포하는 짧은 회문구조 반복 서열(Clustered Regulary Interspaced Short Palindromic Repeats, CRISPR) 시스템 구조의 특성을 탐색하였다. 본 논문은 BLAST, 서열 비교, RNA 2차 구조 예측 등 방법을 통하여 시겔라균 CRISPR에 대해 연구하였다. 연구 결과, 시겔라균의 4개 군체에서 CRISPR 구조를 발견하였으며, 그 측면 상, 하류 서열은 같은 그룹 군집으로 나눌 수 있었고, leader 서열에 회문 성질을 가진 상대적으로 보수적인 motif가 존재하였다. 측면 서열과 반복 서열은 같은 조로 나누어졌고, 반복 서열은 일정한 보수성이 있었으며, '줄기'를 주로 하고 '고리'를 주로 하는 2가지 유형의 서로 다른 RNA 2차 구조를 형성하였다. 간격 서열은 플라스미드 또는 박테리오파지(bacteriophage)와 일정한 상동성을 갖고 있었다. 본 연구 결과, 반복 서열과 측면 서열 사이에 상관관계가 존재하였으며, 반복 서열은 식별 메커니즘으로써 외인성 원소와 Cas 단백질 사이의 상호 작용을 유도할 수 있다. |
