| 저자(한글) |
XU, Yu-lan,BAI, Qing-song,ZHANG, Rui-li,TIAN, Bin,WANG, Da-wei,HE, Cheng-zhong,CAI, Nian-hui,KANG, Xiang-yang,DUAN, An-an |
| 초록 |
목적: 미소 부수체 풍부 유전자 라이브러리(microsatellite enriched genomic library)의 서열 특징을 분석하여, 운남송 유전체 미소부수체(Genomic microsatellite)의 분포특징 또는 변화패턴(Variation pattern)을 탐구하고자 한다. 방법: 자성 입자 강화법(Magnetic beads enrichment)을 이용하여, 운남송 유전체 DNA의 RsaI 소화 산물에서 미소 부수체의 절편을 강화하고, 그 강화된 절편을 용리(Elution), 벡터 연결 및 전화 등 링크를 거쳐, 라이브러리에 대한 감정 및 시퀸싱 작업을 진행하여 그 서열 특징을 분석한다. 결과: 시퀸싱으로 얻은 서열 159개에서, 143개 서열이 중복 횟수가 3회 이상인 미소 부수체 서열을 포함하고 있었으며, 그 서열의 길이는 135~1,138bp, 평균 길이는 520bp이며 복사 비율은 89.94%였다. 이상의 서열에서 디누클레오티드의 일정 단위 반복형(Dinucleotide repeat type)이 56.64%로 가장 많았고, 그 다음으로 트라이뉴클레오타이드 반복형은 51개로서 35.66%를 차지하였으며, 이 외 4-6bp의 미소 부수체 서열이 7.70%로 소량 나타났다; 각 반복형 단위의 염기 조성은 탐침(Probes) 및 상보적 서열(complementary sequence)이 위주였고, 소량의 비탐침 유형도 나타났다; 반복 차수는 3~15번이었고, 반복형의 단위의 길이가 증가됨에 따라 그 빈도는 감소되었다. 결론: 운남송 미소 부수체 풍부 유전자 라이브러리의 미소 부수체 반복 유형, 반복형 단위의 염기 구성 및 서열 길이의 변화를 분석함으로써, 운남송 유전체 미소부수체의 분포특징 또는 변화패턴을 분석하는데 기반을 마련하였으며, 나아가 SSR마커(SSR marker) 개발에 기본정보를 제공하였다. |
