| 저자(한글) |
LI, Zheng,DAN, Hui-hui,QI, Ya-lin,LIU, Lei,HAN, Su-zhen |
| 초록 |
본 논문은 16S rDNA PCR-RFLP와 16S rDNA 전체 서열 분석 기술로 중국 간쑤(Gansu) 지우취안(Jiuquan), 자위관(Jiayuguan) 등 8개 지역 완두(Pisum sativum), 강낭콩(Phaseolus) 등 몇가지 서로 다른 콩과 식물의 뿌리혹(nodule)에서 분리한 53주(strain) 실험용 균주와 9주 대조 균주에 대하여 유전적 분석 및 계통 발생 분석을 진행하였다. 16S rDNA PCR-RFLP 분석 결과, 77.5% 유사성 수준에서 전부 실험용 균주를 5개 분류로 나눌 수 있었다. 분류 I은 Sinorhizhobium-Rhizobium, 분류 II는Agrorhizobium-Bradyrhizobium, 분류III은 알려지지 않은 실험용 균주, 분류 IV는 Mesorhizobium, 분류 V는 2주의 알려지지 않은 실험용 균주로 조성되었다. 89.8% 유사성 수준에서 분류 I에는 2개 하위 분류(sub branches)가 포함되어 있었는데, 하위 분류 1은 CNU1008 등 14주 실험용 균주로 조성되었고 Sinorhizobium meliloti LISPA1002 T 균주와 같은 분류에 속하였으며, 하위 분류 2는 6주의 알려지지 않은 균주로 조성되었고 Rhizobium leguminosarum USDA 2370 T 균주와 같은 분류에 속하였다. 분류 II에는 3개 하위 분류가 포함되어 있었는데 하위 분류 1에는 CNU 1041 등 4주 균주가 포함되어 있었고, 2주 균주 Agrobacterium tumefaciens IAM 13129 T 및 IAM 13569 T 와 같은 분류에 속하였으며, 하위 분류 2에는 5주 균주가 포함되어 있었고, Bradyrhizobium japonicum USDA 6 T 균주와 같은 분류에 속하였으며, 하위 분류 3에는 3주의 알려지지 않은 균주가 포함되어 있었다. 각 분류와 하위 분류에서 전형적인 균주를 선택하여 16S rDNA 서열 측정을 진행한 결과, 2종 분석 방법으로 측정한 결과는 비교적 좋은 일치성을 가졌다. 분류 I의 Sinorhizobium 하위 분류 균주는 S. fredii 및 S. meliloti와 유사성이 99%에 도달하였으며, 해당 하위 분류 균주의 구체적인 계통발생학적 지위는 DNA-DNA 교잡으로 확정하여야 한다. 분류 I의 Rhizobium 하위 분류 균주는 R. giardinii와 유사성이 99%에 도달하였고, R. etli와 유사성이 98%였다. 마찬가지로 해당 하위 분류의 구체적인 계통발생학적 지위도 DNA-DNA 교잡으로 확정하여야 한다. 분류 II의Agrobaterium 하위 분류 균주는 A. rubi와 유사성이 99%에 도달하였다. 분류 II의 Bradyrhizobium 하위 분류 균주는 B. liaoningense와 유사성이 99%에 도달하였다. |
