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논문 기본정보

Bacterial diversity in Bole river entrance soil of Ebinur Lake wetland, Xinjiang by 16S rRNA gene sequence analysis

논문 개요

기관명, 저널명, ISSN, ISBN 으로 구성된 논문 개요 표입니다.
기관명 NDSL
저널명 微生物學通報 = Microbiology
ISSN 0253-2654,
ISBN

논문저자 및 소속기관 정보

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저자(한글) HAN, Jing,HU, Wen-ge,WANG, Yan-ping,WU, Fei,ZHANG, Xiao-hong,WANG, Cui-hua
저자(영문)
소속기관
소속기관(영문)
출판인
간행물 번호
발행연도 2014-01-01
초록 [목적] 신장(Xinjiang) 아이비 호 습지 국가급 자연보호구(Ebinur Lake wetland National Nature Reserve)의 배양에 비의존적인 토양의 세균 군집 구성 및 다양성을 이해하는 것이다. [기법] 배양 비의존적 방법(culture independent method)을 이용하여 직접 습지 토양으로부터 총 DNA(total DNA)를 추출하여 세균의 16S rRNA 유전자 클론 라이브러리를 구축한다. 제한효소(restriction endonuclease) Msp I와 Afa I를 사용하여 양성 클론에 대한 16S rRNA 유전자 증폭 조각의 제한효소 절단 분석(Amplified rDNA restriction analysis, ARDRA)을 진행한다. 또한, 서로 다른 이중 효소 절단 지도를 갖는 클론을 선택하여 서열 측정, 서열 비교를 진행하며 16S rRNA 유전자 계통수(phylogenetic tree)를 구축한다. [결과] 토양 세균의 16S rRNA 유전자 라이브러리에서 75개의 효소 절단 지도가 서로 다른 클론(clone)을 임의로 선발하여 모두 58개 OTUs를 얻었으며 계통발생학적 분류에 따라 Chloroflexi, Cyanobacteria, Proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria, Bacteroidetes, Verrucomicrob 및 Gemmatimonadetes 등의 8개 세균 군집으로 분류하였다. 그중, Proteobacteria는 1위 우점종 군집이고 Bacteroidetes는 2위 우점종 군집이었으며 이 두 개 우점종 군집은 전체 클론의 65%를 차지하였다. [결론] 아이비 호 습지의 보러강(Bole river) 입구 토양은 세균 다양성이 풍부하였으며 일정 수량의 잠재적인 새로운 미생물 종이 존재하였다.
원문URL http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART75843250
첨부파일

추가정보

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과학기술표준분류
ICT 기술분류
DDC 분류
주제어 (키워드) Bacterial diversity,16S rRNA gene clone library,The Ebinur Lake wetland,Amplified rDNA restriction analysis,세균 다양성,16S rRNA 유전자 클론 라이브러리,아이비 호 습지,제한효소 절단 분석