저자(한글) |
HAN, Jing,HU, Wen-ge,WANG, Yan-ping,WU, Fei,ZHANG, Xiao-hong,WANG, Cui-hua |
초록 |
[목적] 신장(Xinjiang) 아이비 호 습지 국가급 자연보호구(Ebinur Lake wetland National Nature Reserve)의 배양에 비의존적인 토양의 세균 군집 구성 및 다양성을 이해하는 것이다. [기법] 배양 비의존적 방법(culture independent method)을 이용하여 직접 습지 토양으로부터 총 DNA(total DNA)를 추출하여 세균의 16S rRNA 유전자 클론 라이브러리를 구축한다. 제한효소(restriction endonuclease) Msp I와 Afa I를 사용하여 양성 클론에 대한 16S rRNA 유전자 증폭 조각의 제한효소 절단 분석(Amplified rDNA restriction analysis, ARDRA)을 진행한다. 또한, 서로 다른 이중 효소 절단 지도를 갖는 클론을 선택하여 서열 측정, 서열 비교를 진행하며 16S rRNA 유전자 계통수(phylogenetic tree)를 구축한다. [결과] 토양 세균의 16S rRNA 유전자 라이브러리에서 75개의 효소 절단 지도가 서로 다른 클론(clone)을 임의로 선발하여 모두 58개 OTUs를 얻었으며 계통발생학적 분류에 따라 Chloroflexi, Cyanobacteria, Proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria, Bacteroidetes, Verrucomicrob 및 Gemmatimonadetes 등의 8개 세균 군집으로 분류하였다. 그중, Proteobacteria는 1위 우점종 군집이고 Bacteroidetes는 2위 우점종 군집이었으며 이 두 개 우점종 군집은 전체 클론의 65%를 차지하였다. [결론] 아이비 호 습지의 보러강(Bole river) 입구 토양은 세균 다양성이 풍부하였으며 일정 수량의 잠재적인 새로운 미생물 종이 존재하였다. |