저자(한글) |
LIU, He,ZHU, Hong-yi,XIAO, Jian-qing,LIU, Zhu-xiang,CHENG, Jin-lian,HE, Jian-wu,LI, Wen-jun,CHEN, Yi-guang |
초록 |
[목적] ] 남중국해(The South China Sea) 나오저우섬(Naozhou Island) 간석지(tidal flat)의 키조개(Atrina pectinata)와 관련되고 배양에 가능한 세균 다양성을 이해하는 것이다. [기법] 순수 배양법(culture-dependent method) 및 16S rRNA 유전자 서열 기반의 계통발생학적 분석(phylogenetic analysis) 방법을 이용하여 샘플 중의 세균(방선균 포함)의 군집 다양성, 종(species) 다양성 및 유전적 다양성을 연구한다. [결과] 0~25%(W/V) NaCl을 보충한 MA, MH와 NA 배양기를 사용하여 키조개 샘플로부터 125주(strain)의 세균을 분리하였다. 형태학적 관찰 및 일부분 생리 및 생화학적 실험 결과를 기반으로 하고 중복성을 제거한 후, 대표적인 균주 90주를 선택하여 16S rRNA 유전자 서열에 기반한 계통발생학적 다양성 분석을 진행하였다. 그 결과, 이 90주 분리 균주는 3개 큰 계통발생적 군집(Gamma-proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria), 6과(family) 10속(genus)에 각각 속하였는데, 33종으로 나뉘었다. 해당 우점종 군집은 Firmicutes(56주, 62.2%) 및 Gamma-proteobacteria(31주, 34.5%)이었다. 대부분의 균주가 그와 계통발생적 관계가 가장 밀접하고 이미 알고 있는 종의 전형적인 균주와의 사이에는 일정한 유전적 차이가 존재하였으며(16S rRNA 유전자 서열 유사성이 95.7%~99.9%임), 그중 5주 균주는 새로운 분류 단위(Potential new taxa)를 대표할 수 있다. 분석 결과, 균주 JSM 112024는 Halomonadaceae 과의 어느 속급 새로운 분류 단위를 대표할 수 있으며, 균주 JSM 112019, JSM 114045, JSM 114058과 JSM 114083은 각각 Salinivibrio, Bacillus, Halomonas와 Virgibacillus 속의 새로운 종을 대표할 수 있다. [결론] 잔저우(Zhanzhou) 나오저우섬 간석지의 키조개 중에는 배양 가능한 세균의 종 다양성과 계통발생학적 다양성이 비교적 풍부하게 존재하였으며, 비교적 많은 새로운 미생물 군집(종)을 감추고 있다는 것을 알 수 있다. |