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논문 기본정보

Phylogenetic diversity of cultivable bacteria associated with Atrina pectinata collected from the tidal flat of Naozhou Island in the South China Sea

논문 개요

기관명, 저널명, ISSN, ISBN 으로 구성된 논문 개요 표입니다.
기관명 NDSL
저널명 微生物學通報 = Microbiology
ISSN 0253-2654,
ISBN

논문저자 및 소속기관 정보

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저자(한글) LIU, He,ZHU, Hong-yi,XIAO, Jian-qing,LIU, Zhu-xiang,CHENG, Jin-lian,HE, Jian-wu,LI, Wen-jun,CHEN, Yi-guang
저자(영문)
소속기관
소속기관(영문)
출판인
간행물 번호
발행연도 2014-01-01
초록 [목적] ] 남중국해(The South China Sea) 나오저우섬(Naozhou Island) 간석지(tidal flat)의 키조개(Atrina pectinata)와 관련되고 배양에 가능한 세균 다양성을 이해하는 것이다. [기법] 순수 배양법(culture-dependent method) 및 16S rRNA 유전자 서열 기반의 계통발생학적 분석(phylogenetic analysis) 방법을 이용하여 샘플 중의 세균(방선균 포함)의 군집 다양성, 종(species) 다양성 및 유전적 다양성을 연구한다. [결과] 0~25%(W/V) NaCl을 보충한 MA, MH와 NA 배양기를 사용하여 키조개 샘플로부터 125주(strain)의 세균을 분리하였다. 형태학적 관찰 및 일부분 생리 및 생화학적 실험 결과를 기반으로 하고 중복성을 제거한 후, 대표적인 균주 90주를 선택하여 16S rRNA 유전자 서열에 기반한 계통발생학적 다양성 분석을 진행하였다. 그 결과, 이 90주 분리 균주는 3개 큰 계통발생적 군집(Gamma-proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria), 6과(family) 10속(genus)에 각각 속하였는데, 33종으로 나뉘었다. 해당 우점종 군집은 Firmicutes(56주, 62.2%) 및 Gamma-proteobacteria(31주, 34.5%)이었다. 대부분의 균주가 그와 계통발생적 관계가 가장 밀접하고 이미 알고 있는 종의 전형적인 균주와의 사이에는 일정한 유전적 차이가 존재하였으며(16S rRNA 유전자 서열 유사성이 95.7%~99.9%임), 그중 5주 균주는 새로운 분류 단위(Potential new taxa)를 대표할 수 있다. 분석 결과, 균주 JSM 112024는 Halomonadaceae 과의 어느 속급 새로운 분류 단위를 대표할 수 있으며, 균주 JSM 112019, JSM 114045, JSM 114058과 JSM 114083은 각각 Salinivibrio, Bacillus, Halomonas와 Virgibacillus 속의 새로운 종을 대표할 수 있다. [결론] 잔저우(Zhanzhou) 나오저우섬 간석지의 키조개 중에는 배양 가능한 세균의 종 다양성과 계통발생학적 다양성이 비교적 풍부하게 존재하였으며, 비교적 많은 새로운 미생물 군집(종)을 감추고 있다는 것을 알 수 있다.
원문URL http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART75843267
첨부파일

추가정보

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과학기술표준분류
ICT 기술분류
DDC 분류
주제어 (키워드) The South China Sea,Atrina pectinata,Cultivable bacteria,16S rRNA gene,Phylogenetic analysis,Biodiversity,남중국해,키조개,배양 가능한 세균,16S rRNA 유전자,계통발생학적 분석,생물 다양성