저자(한글) |
SU, Jian,DAI, Xi-lin,LIU, Hong,LIU, Wei-li,GAO, Xiang,LIU, Jie,DING, Fu-jiang |
초록 |
Macrobrachium rosenbergii의 상하이 양식 개체군(Shanghai population)의 생체에서 아가미, 근육, 간췌장, 혈액과 웅성 생식선 등 5개 조직의 총 RNA를 추출하였다. RT-PCR 기술을 이용하여, 아가미 조직에서 Toll 유사 수용체(toll-like receptor, TLR) 유전자 부분의 cDNA 서열을 클로닝한 후 생물정보학적 분석을 진행하였다. 유전자 서열을 분석한 결과, Macrobrachium rosenbergii의 TLR 유전자의 cDNA 서열 길이는 1,875 bp였는데 1,728 bp의 개방형 해독틀(open reading frame)을 포함하고 있었으며 575개 아미노산 잔기를 인코딩할 수 있었다. 해당 부분의 TLR은 하나의 막관통 단백질(transmembrane protein)로서 세포 외부영역에는 LRR, LRR-CT, LRR-NT 도메인이 있었으며 핵심 세포 내부영역에는 TIR 도메인이 있었고 Toll 유사 수용체 구성원의 전형 구조 특성을 갖고 있었다. TIR 도메인과 흰다리새우(Litopenaeus vannamei), 보리새우(Marsupenaeus japonicus), 대하(Fenneropenaeus chinensis), 얼룩새우(Penaeus monodon), 참게(Eriocheir sinensis), 톱날꽃게(Scylla Paramamosain) Toll 유사 수용체 유전자의 TIR 영역 내 아미노산 서열은 아주 높은 유사성을 나타냈다. |