초록 |
[목적] 기름골(Cyperus esculentus L.) 에놀피루빈산 인산 카르복시화 효소(phosphoenolpyruvate carboxylase, PEPCase) 유전자의 분자 복제에 대해 초보적으로 분석한다. [방법] GenBank 중 기타 식물 PEPCase 유전자에 대한 상동성 비교를 통하여 축퇴성 프라이머(degenerated primers)를 설계하였으며, PCR법으로 PEPCase 코딩 유전자 ppc의 2개 조각 S1과 S2를 복제하여 얻었다. [결과] S1, S2 조각 길이는 각각 577 bp와 190 bp이며, 생물정보학 분석 결과, S1 조각은 모두 ppc 유전자의 8번째 엑손 영역에 위치하였고 S2 조각은 ppc 유전자 8번째 엑손 3'단 서열, 9번째 엑손 5'단 서열 및 그것들 사이의 인트론 영역을 포함하였다. [결론] S1, S2 조각 길이는 각각 577 bp와 190 bp이다. Blast 비교 결과, 기름골 ppc 유전자의 S1, S2 전체 길이 조각과 Cyperus ustulatus(PEPC-C4-1), Cyperus longus, Cyperus iria, Cyperus papyrus의 상동성은 97%이며 Cyperus rotundus과의 상동성은 96%이다. 진화수 분석 결과, 기름골 ppc 유전자 S1과 S2 조각은 방동산이속 (Cyperus L.) Cyperus ustulatus, Cyperus longus, Cyperus iria 등의 ppc 유전자와의 진화 혈연관계가 가장 가까웠다. |