| 저자(한글) |
QI, Qi,QI, Yun-yue,YANG, Hui,BI, Cai-hong,HAN, Xiao-di |
| 초록 |
본 논문은 꺽정이(Trachidermus fasciatus) 혈액응고인자 XI(coagulation factor XI)의 유전자 cDNA 서열을 클론한 후 발현 패턴을 분석하였다. RACE 기술로 꺽정이에서 혈액응고인자 XI의 cDNA 전체 서열(TfXI라고 명명)을 클론하여 획득한 후 해당 서열에 대하여 생물정보학적 분석 및 발현 패턴 분석을 진행하였다. 전체 길이가 1,287 bp인 TfXI cDNA를 획득하였는데 해당 TfXI cDNA에는 13 bp인 5' 말단 비코딩 영역, 1,143 bp인 개방형 해톡틀, 131 bp인 3' 말단 비코딩 영역이 포함되어 있었다. 개방형 해독틀은 280개 아미노산의 폴리펩티드 사슬(polypeptide chain)을 코딩하였고, 예측한 단백질 크기가 42.9 kD였다. N 말단에 22~105위치 아미노산, 112~196 위치 아미노산, 205~279 위치 아미노산, 289~369 위치 아미노산으로 구성된 4개의 직렬 배열된 전형적인 APPLE 도메인이 함유되어 있었다. NCBI Blast 검색 결과, TfXI는 기타 종류의 혈액응고인자 XI와 유사성이 30%~63%였고, 계통수 분석 결과, TfXI는 전통적인 진화 규칙에 적합하였다. 실시간 PCR 분석 결과, LPS로 96시간 자극한 후 꺽정이 비장(spleen)에서 TfXI의 발현량이 뚜렷하게 증가하였다(P |
