| 저자(한글) |
ZHANG, Nan,SUN, Gui-ling,DAI, Jun-gui,YANG, Yan-fang,LIU, Hong-wei,QIU, De-you |
| 초록 |
Illumina Genome Analyzer IIx로 은행엽(Ginkgo Biloba)세포 전사체에 대해 높은 처리율 분석을 한다. 은행엽 락톤과 파클리탁셀 바이오합성 유전자를 발굴하는데 특히 새로운 수산화효소 유전자는 주목 식물세포 파클리탁셀 바이오합성 방법에서 미지의 수산화 반응을 위해 준비를 하고 있다. 분석으로 은행엽세포 69286개 contig, 56387개 scaffold, 32032개 unigene를 획득하였다. Unigene의 평균길이는 636bp이다. Gap 분포, GC 함량, 게놈 coverage 등 면으로 unigene에 대해 평가를 하였다. 데이터 결과 분석 질량이 좋고 신뢰성이 높다. Unigene의 발현과 기능 주석 등 정보 분석결과 CYP450의 유전자 가족에 속하는 66개를 발견하였다. 또한 726개가 2차 대하물 합성에 참여하였는데 그 중에서 59개는 테르페노이드 합성과 연관되고 17개는 디테르펜 합성과 연관이 있다. 생물정보학 방법으로 Michigan State University 은행 성숙엽, 곁뿌리, 성숙열매, 무균씨앗, 덧가지의 전사체 데이터에서 은행엽 세포 CYP450과 상동의 탁산 수산화효소 후보 유전자 15개를 찾았다. 이는 후속적인 연구에 있어서 기초를 마련해 주었다. |
