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논문 기본정보
Identifying Markers of Hepatocellular Carcinoma for Early Diagnosis Based on the Relative Expression Orders of Genes in Cirrhosis Tissues Adjacent to Carcinoma
논문 개요
| 기관명 | NDSL |
|---|---|
| 저널명 | 生物物理學報 = Acta biophysica sinica |
| ISSN | 1000-6737, |
| ISBN |
논문저자 및 소속기관 정보
| 저자(한글) | ZHANG, Lin,HAO, Chun-xiang,CHEN, Bei-bei,LIAO, Zhi-jun,GUO, Zheng |
|---|---|
| 저자(영문) | |
| 소속기관 | |
| 소속기관(영문) | |
| 출판인 | |
| 간행물 번호 | |
| 발행연도 | 2013-01-01 |
| 초록 | 현재 간암(hepatocellular carcinoma, HCC)에 대한 조기 진단(early diagnosis) 과정에서 방사선 영상(radiological image) 기술로 진단하지 못하는 현상이 존재하기에 일반적으로 샘플을 수집하여 조직병리학적 검사(pathological examination)를 진행하여 진단한다. 그러나 일부분 초기 간암 조직에서 발현되는 병리적 변화는 아주 적기에 샘플을 수집하여 검사하는 과정에서도 정확한 암조직 샘플을 수집하지 못하여 간암을 진단하지 못하는 현상이 흔히 발생한다. 상술한 임상에서 간암을 조기 진단하는 과정에서 존재하는 문제점과 유전자 발현 프로필(gene expression profile)을 이용한 검사 배치 효과(batch effect)가 분류 결과(classification results)에 미치는 영향을 해결하기 위해 저자는 종양 인접 조직(tissue adjacent to carcinoma)에서 유전자 발현 순서(gene expression orders) 관계를 이용하여 초기 간암 및 간암이 발생하기전의 병리학적 변화(pathologic change)를 진단하는 방법을 제안하였다. 우선 간암 환자의 간경변 조직(cirrhosis tissue in patients with HCC, wHCC)과 간암이 없는 환자의 간경변 조직(cirrhosis tissue in patients without HCC, woHCC) 사이에서 유전자 발현값(gene expression data)이 상대적인 변화가 발생한 유전자쌍(gene pairs)을 검색하였다. 그 다음으로 대량의 샘플에서 간암 조직 발현 프로필 데이터에 근거하여 HCC 및 wHCC에서 발현되는 순서가 상대적으로 일치한 유전자쌍을 선별하였다. 마지막으로 선별한 유전자쌍에 기반하여 HCC, wHCC 및 woHCC를 선별할 수 있는 분류기(classifier)를 연구개발하였다. 연구 결과, 해당 분류기는 서로 다른 플랫폼(platforms) 및 서로 다른 실험실에서 수집한 샘플에 대하여 모두 안정하게 분류하는 기능이 있기에 초기 간암의 보조적인 식별 및 진단에 이용될 수 있다. |
| 원문URL | http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART69978331 |
| 첨부파일 |
추가정보
| 과학기술표준분류 | |
|---|---|
| ICT 기술분류 | |
| DDC 분류 | |
| 주제어 (키워드) | Hepatocellular carcinoma,Tissue adjacent to carcinoma,Cirrhosis,Diagnosis,Gene expression,간암,종양 인접 조직,간경변,진단,유전자 발현 |