| 저자(한글) |
JIANG, Xiang-mei,WU, Yan-fang,XIAO, Fu-ming,XIONG, Zhen-yu,XU, Hai-ning |
| 초록 |
녹나무(Cinnamomum camphora )는 녹나무과의 대표종으로 목재용, 약용, 향료용, 기름용 및 생태 환경 건설 등 여러가지 용도가 있다. 잎을 정제하여 얻은 기름중에는 이용가치가 높은 장뇌(camphor), 리날놀(linalool), 1,8-시네올(cineol), 네롤리돌(iso-nerolidol) 및 보르네올(borneol) 등 테르페노이드(terpenoids) 화합물이 많이 들어있다. 잎을 정제하여 얻은 기름에 들어있는 주요 성분의 종류와 함량에 근거하여 녹나무를 장뇌, 리날놀, 장뇌유, 네롤리돌, 보르네올 등 5가지 화학 유형으로 나눈다. 본문은 Illumina HiSeq trade; 2000 초고속 서열분석(high-throughput sequencing)기술을 이용하여 5가지 화학 유형 잎 전사체에 대하여 서열 측정을 진행하였다. 그리고 측정하여 얻은 모든 Unigene 을 GO(Gene Ontology)、COG(Clusters of Orthologous Groups) 및 KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)로 분류하여 기능 어노테이션 및 Pathway 어노테이션을 진행하였으며 Unigene 단백질 암호 구역(Coding sequence, CDS)을 예측하였다. De novo 조립으로 156,278개의 Unigene을 얻었으며 서열의 평균 길이는 584 bp이고 N50(50%의 모든 염기를 커버리지한 제일 큰 Unigene 길이)는 1,023 bp이다. 다른 핵산, 단백질 데이터베이스의 Blast 와 검색 비교 결과, 55,955개의 Unigene가 유전자 어노테이션을 얻었으며 모든 Unigene의 35.80%를 차지한다는 결과를 얻었다. 그중에서 24,717개의 Unigene가 GO 어노테이션을 얻었으며 21,806개의 Unigene가 COG 어노테이션을 얻었다. KEGG pathways 분석 결과, 3,350개의 유전자(10.19%)가 차생 대사 바이오 합성 경로에 어노테이션 되였고 그 중에서 모노테르펜, 디테르펜, 세스퀴테르펜 및 테르페노이드 골격 합성에 참여하는 Unigene가 424개이다. 모노테르펜으로 합성된 대사 경로중 9개의 Unigene 는 리날놀 합성효소 유전자를 코딩할 가능성이 있고, 발현 분석 결과, 리날놀 합성 유전자가 리날놀 화학 유형중에서 우수하게 발현되였지만 장뇌유 화학 유형에서 낮게 발현되였다. 이런 어노테이션의 완료는 녹나무 기능 유전자 및 연관 후보 유전자 발굴에 기초적 수치와 중요한 근거를 제공하였다. |
