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논문 기본정보
Analysis of Combinatorial Transcriptional Regulatory Elements in Promoters of Human Housekeeping Genes
논문 개요
| 기관명 | NDSL |
|---|---|
| 저널명 | 生物化學與生物物理進展 = Progress in Biochemistry and Biophysics |
| ISSN | 1000-3282, |
| ISBN |
논문저자 및 소속기관 정보
| 저자(한글) | LI, Hui-min,SHI, Yu,YANG, Zhi-gang,JIANG, Shao-ping |
|---|---|
| 저자(영문) | |
| 소속기관 | |
| 소속기관(영문) | |
| 출판인 | |
| 간행물 번호 | |
| 발행연도 | 2015-01-01 |
| 초록 | 연구에 의하면 첫번째 인트론(first introns)은 유전자 전사 조절에 관여하는 것으로 나타났다. 통계적 방법을 사용하여 인간 하우스키핑(housekeeping, HK) 유전자 상위에서부터 첫번째 인트론에 이르는 서열에 잠재해 있는 복합 전사 조절 모티프(combinatorial transcriptional regulatory motifs)를 추출한 다음 모티프 간의 거리, 영역 분포 등 특성을 분석하였다. 그 다음 인트론이 관여하는 유전자 전사 조절의 가능성과 관여 방식을 연구하였다. 하우스키핑 유전자로부터 총 960 쌍의 잠재성 전사 조절 모티프 쌍을 획득하였다. 이 가운데 57%는 실험에서 이미 밝혀진 전사 상호 작용이 있는 인자와 일치하였고 총 12그룹의 인자 쌍과 연관이 있었다. 분석 결과, 대부분 모티프 쌍( gt;80%)은 상위 영역과 '상위-인트론' 영역에 치우쳤다. 이는 인트론이 유전자 전사 조절에 관여한다는 가설을 한층 더 뒷받침하였다. 또한 이에 근거하여 인트론과 상위 서열 사이에 전사 협동 작용이 있다는 것을 추정하였다. 모티프는 유전자 전사 시작 부위(TSS) 부근에 보다 집중되었다. 모티프 쌍의 두개 모티프 간 거리는 가까웠다. 모티프 간 거리에서 약 60%는 200 bp 이내였고 특히, 65% 모티프 쌍의 특성화 거리는 100 bp 이내였다. 짧은 거리 간격은 전사인자 간의 협동 작용에 도움이 되었다. 이러한 결과는 인간 유전자 전사 조절 메커니즘 및 인트론 기능에 대한 깊이있는 이해에 도움이 되었다. |
| 원문URL | http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART72351008 |
| 첨부파일 |
추가정보
| 과학기술표준분류 | |
|---|---|
| ICT 기술분류 | |
| DDC 분류 | |
| 주제어 (키워드) | human housekeeping genes,combinatorial transcriptional regulation,motif pairs,introns,location preference,distance distribution,인간 하우스키핑 유전자,복합 전사 조절,모티프 쌍,인트론,영역 선호,거리 분포 |