초록 |
고유유전자(orphan gene)는 개체의 게놈(genome)에 존재하며, 기타 개체에는 존재하지 않는 특수 유전자이다. 고유유전자의 감정과 분석은 이미 비교유전체학(comparative genomics)의 연구에서 새로운 분야로 되었다. 본 연구는 생물정보학(bioinformatics) 분석을 통하여 49개 포도(grape) 고유유전자의 각 발육 단계와 각 기관(organ)에서 특이적 발현(specific expression) 특성, 아세포 위치 예측(subcellular localization prediction)과 유전자 온톨로지(gene ontology, GO)분석을 연구하였다. 연구 결과, 35개 유전자는 NCBI의 EST 데이터베이스에 EST 발현이 존재한다는 증거가 있었다. 그 중에서 7개 유전자는 기관 특이성 발현(organ specific expressed)되며, 또한 대부분이 생식기관에서 특이성있게 발현된다. 아세포 위치 결정으로 예측한 결과 대부분 포도 고유유전자는 단백질을 분비하였다. GO 분석 결과, 포도 고유유전자의 공발현 유전자 집단(co-expressed genes)은 주로 올리고펩티드 전환(oligo-peptide transport)과 막투과 전달(transmembrane transport) 등 생물학적 과정에 참여하는 것으로 나타났다. 이는 포도 고유 유전자의 아세포 위치결정으로 예측한 결과와 일치하였다. 연구 결과는 포도 고유유전자의 기능분석에 중요한 연구 기초를 제공하였다. |