| 저자(한글) |
XIAO, Qian-cheng,PENG, Si-lu,LI, Er-han,ZHU, Du,YANG, Hui-lin |
| 초록 |
Streptomyces mobaraensis는 GC 함량이 높은 그람 양성 방선균(gram-positive actinomycetes)으로서 트랜스글루탐산 분해효소(transglutaminase), 블레오마이신(bleomycin), 모넨신(monensin) 등의 생산에 광범위하게 적용된다. 기존에 Streptomyces mobaraensis의 전유전체 서열에 관한 보고가 아직 없어 기능성 유전자의 발굴과 이용에 기초한 방향성 육종 및 분자 유전학에 대한 연구는 한계가 있었다. 본 연구는 처음으로 초고속 시퀀싱 기술(high-throughput sequencing technology)을 통해 Streptomyces mobaraensis DSM 40847에 대하여 전유전체 서열 측정을 진행하였다. 또한, Velvet 소프트웨어를 사용해 266 contigs를 조합하여 얻었으며, 전체 유전체 크기는 약 7.5 Mb이고 GC 함량은 73.2%이었다. 그리고 얻은 서열은 이미 미국 국가생물기술정보센터(National Center for Biotechnology Information, NCBI)의 GenBank 데이터베이스에 제출하였다. 유전체 서열을 분석하여 트랜스글루탐산 분해효소 효소원 활성 관련 단백질 유전자를 성공적으로 감정하였으며 해당 균주의 2차 대사산물 합성 유전자 집단을 예측하였다. 해당 연구 결과는 Streptomyces mobaraensis의 기능성 유전체학 연구에 기초 데이터를 제공할 수 있다. |
