저자(한글) |
GUO, Gai-gai,WU, Hong-xing,LIU, Ming-wei,DING, Chen,QIN, Jun,YANG, Xiao-ming |
초록 |
사염화탄소(Carbon tetrachloride, CCl4) 유도에 의한 생쥐 간 섬유화(liver fibrosis) 모델을 연구하여 섬유화 간 조직과 정상 간 조직의 단백질체학 수준에서의 차이를 발견하고 해당 차이를 논의하였다. 실험 생쥐(C57 BL/6)를 임의로 두 개 그룹으로 나누고 올리브유와 사염화탄소로 15주 동안 유도하였다. 그리고 질량 분석법으로 두 개 그룹 간조직의 총 단백질 발현 스펙트럼을 검측하고 GO(GeneOntology) 기능 분류 분석과 KEGG(Kyoto Enyoolpedia of Genes and Genomes) 신호 통로의 농축 분석 방법을 응용하여 감정을 통해 얻은 총 단백질 발현 스펙트럼에 대하여 차이성 발현 분석(differential expression analysis)을 수행하였다. 대조그룹과 실험그룹에서 특이성 펩타이드 단락을 각각 17,382와 20,486 가닥 감정하였다. 그래프 평균 이용률이 50%이상, 총 4,991종 단백질을(단백질 특이성 펩타이드 단락 개수가 적어서 1개) 감정하였다. 그중에서 차이성 발현 단백질이 2,135종(차이성 배수가 2, 혹은 2이상), 발현 상향 단백질이 1,264종, 하향 단백질이 871종이었다. 섬유화 간조직에서 세포 외 기질 구성(Extracellular matrix organization), 세포골격 구성(Cytoskeleton organization), 유기인산 대사 (Organophosphatemetabolic process), 세포 위치 결정(Cellular localization)과 세포 구성 성분의 조절(Regulationof cellular component organization)과 관련되는 단백질의 발현은 상향 조절되었다; 이밖에 소분자 대사(Smallmolecule metabolic process), 단백질 운반(Protein transport)과 유기질소 화합물의 대사(Organonitrogen compound metabolic process), 및 테트라피롤의 합성과정(Tetrapyrrole biosynthetic process)과 관련되는 단백질의 발현은 하향 조절되었다. 신호 통로에 대한 농축 분석 결과, 섬유화가 VEGF와 T 세포 수용체의 신호 조절 통로와 밀접한 연관이 있다. 실험은 섬유화의 형성이 복잡한 신호 전달 과정일 뿐만 아니라 염증과 면역이 상호 촉진하여 형성된 결과이다; 간 실질세포의 생존을 강화하고 관련 신호의 전달 및 수신을 낮추면 섬유화의 발생과 발전을 억제할 수 있다는 것을 설명한다. |