| 저자(한글) |
YU, Kai-cheng,WANG, Jian-xin,TAO, Shi,LIU, Ming-hua,JIANG, Ran,LIU, Xue-zhu,HUANG, Bei |
| 초록 |
본 논문에서는 3쌍의 일반 프라이머(ITS1/ITS4, EF3/EF4, NS1/NS4)를 이용하여 이가 동중국해 대륙붕 DH-13 위치에서 채집한 표층 퇴적물의 진핵 미생물(microeukaryote)에 대한 증폭 특이성 및 종다양성의 차이를 검사하였다. 323개의 유효한 클론체를 대상으로 OTU 분류(classification) 및 다양성 분석을 수행한 결과, NS1/NS4 프라이머로 증폭하여 얻은 라이브러리의 종다양성이 가장 높았고 EF3/EF4이 그 다음으로 높았으며 ITS1/ITS4가 가장 낮았다. NCBI 비교 및 분류학적 연구를 통하여 확인한 결과, 우점종은 원생생물계였으며 그중에는 사족충문(Cercozoa, 전부 OTU의 36.4%를 차지함), 와편모조강 (Dinophyceae, 14.2%를 차지함), 부등편모조류문 (Stramenopiles, 7.4%를 차지함), 섬모충문 (Ciliophora, 6.3%차지함) 등이 포함되었다. 그 외, 일부 진균계 즉 자낭균문(Ascomycota, 7.4%를 차지함) 및 호상균문(Chytridiomycota, 6.3%를 차지함) 등도 검출되었다. 원생생물에서 NS1/NS4 프라이머는 종다양성을 가장 많이 나타낼 수 있었고 사족충문, 와편모조강 및 부등편모조류문을 증폭하는데 적합하였으며 또한 특유의 유글레나류(Euglenozoa), 은편모조식물문(Cryptophyta) 및 포자충문(Apicomplexa)에 증폭시켰다. ITS1/ITS4는 쌍편모조류 및 섬모충문을 증폭하는데 적합하였고 EF3/EF4는 사족충문을 증폭하는데 적합하였다. 진균생물에서 ITS1/ITS4는 자낭균문을 증폭하는데 적합하였고 EF3/EF4는 자낭균문 및 호상균문을 증폭하는데 적합하였으며 NS1/NS4는 호상균문을 증폭하는데 적합하였다. 계통발생학적 분석 결과, 3쌍 프라이머의 원생생물 계통수에서의 유사한 염기서열은 대부분 해양 환경 샘플에서 확보한 것이지만 진균의 염기서열은 각각 육지 토양 진균 및 해양 진균에서 확보한 것이었는데 이는 3쌍의 프라이머가 해양 퇴적 환경 내 원생 미생물의 분자생태학적 분석에 더 적합하다는 것을 설명한다. |
