| 저자(한글) |
JIANG, Qin-yang,SHEN, Xia-shuang,HUANG, Jun,ZHONG, Rui-peng,GUO, Ya-fen,HUANG, Yan-hua,TANG, Yi-bo,YAN, Xue-yu |
| 초록 |
본 논문은 일반 PCR 증폭 및 서열 측정 방법을 이용하여 Cyclemys dentata의 미토콘드리아 DNA(mtDNA) 전체 서열을 획득한 후 mtDNA 유전체의 구조 특성을 연구하였다. 20종 거북(turtle)의 미토큰드리아 유전체 중쇄 단백질을 코딩하는 유전자 서열을 근거로 하고, 최대 간소화 방법(maximum parsimony, MP), 최대 우도법(maximum-likelihood, ML)과 베이지안 방법(Bayesian methods)으로 계통수(phylogenetic tree)를 구축하는 것을 통하여 해당 거북(turtle) 개체 사이의 계통진화 관계(phylogenetic relationships)를 연구하였다. 연구 결과, Cyclemys dentate의 미토큰드리아 유전체 전체 서열 길이 16,489 bp[유전자은행(GenBank) 등록번호 JX455823], A+T 함량61.51%이고, 37개 유전자를 코딩하며, 13개 단백질을 코딩하는 유전자를 포함하고, 2개 rRNA, 22개 tRNA와 1개 제어 영역(control region)(Dloop)이 있고, 유전자 조성은 기타 거북류 동물과 유사하였다. 비코딩 영역의 D-loop 길이는 973 bp이고, 1개의 중심 보존 영역(central conserved domain, CD), 2개의 확장 말단과 결합된 서열 영역(extended termination associated sequences, ETASs), 3개의 보존 서열 블록(conserved sequence blocks)이 있었다. 구축한 MP 계통수, ML 계통수와 Bayesian 계통수의 토폴로지 구조(topological structure)는 유사한 것으로서 Cuora 속의 7종 거북은 같은 종류에 속하였고, Mauremys 속의 6종 거북은 같은 종류에 속하였으며, C. dentate와 C. atripons는 같은 종류에 속하였다. 상술한 3가지 계통수는 이미 분류한 거북 개체군의 분류학적 위치와 일치하였다. |
