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장비
장비 및 시설 기본정보
실시간유전자증폭기
장비 개요
| 기관명 | ZEUS |
|---|---|
| 장비번호 | |
| 제작사 | Applied Biosystems |
| 모델명 | Step One Plus Real Time PCR System |
| 장비사양 | |
| 취득일자 | 2013-01-28 |
| 취득금액 |
보유기관 및 이용정보
| 보유기관명 | 건양대학교 산학협력단 |
|---|---|
| 보유기관코드 | |
| 활용범위 | |
| 활용상태 | |
| 표준코드 | B201 |
| 표준분류명 | |
| 시설장비 설명 | Real time PCR법은 PCR 증폭산물의 증가를 실시간으로 모니터링하여 해석하는 기술이다. End Point에서 PCR 증폭산물을 확인하는 기존의 PCR법에 비해서 다음과 같은 잇점을 갖고 있다. ① DNA와 RNA의 정확한 정량이 가능하다.② 전기영동이 필요 없어 신속하고 간편하게 해석할 수 있으며 오염의 위험성이 적다. 현재는 유전자 발현해석과 SNP typing 등에 있어 필수적인 기술이 되고있다. Real time PCR에서는 PCR 증폭산물을 Real time으로 모니터링하여 증폭이 지수적으로 일어나는 영역에서 정량하기 때문에 기존 기술인 RT-PCR법과 달리 PCR의 증폭속도 이론을 기초로 정확한 정량이 가능하다.I. 염기서열 검출 시스템 1. 화학물질 (1) Fluorogenic 5' Nuclease Assay 방식 (2) TaqMan MGB 분석방식 (3) 두 가닥 DNA 결합 염료 SYBR Green I 방식 2. 내장 thermal cycler 1) 기본 블록 방식 (1) 동적범위 : 9 logs의 직선 동적범위 (2) 정량 PCR의 운영시간 : 빠른 분석조건 : 40분 / 40 cycle (TanMAn RNaseP Verification Test Plate를 사용) 기본 분석조건 : 2 시간 / 40 cycle (3) 가열 및 냉각 장치 : Peltier 방식 (4) 블록 형태 : VeriFlex Block (25℃ 5℃ zone to zone) (5) 온도 범위 : 4.0 ~ 100℃ (6) 처리 용량(시료 수) : 최대 96개 (7) 반응 용액 부피 : 10ul ~ 30ul (8) 가열 및 냉각 속도 - 빠른 분석조건 +/- 2.2 ℃/초 - 기본 분석조건 +/- 1.6 ℃/초 (9) 온도 균일성 : ±0.5℃ (35-95℃ 온도 범위에서 30초동안의 실험 결과) (10) 온도 조절 정밀성 : ±0.25℃ (35°- 95℃ 온도 범위) (11) 접촉 화면 : LCD/ 6.6inch. full VGA (640*480)/260K colors (12) Melt curve 분해능 : 0.1℃ (13) 온도 보정 : NIST (National Institute for Standards and Technology U.S.) 채택 3. 형광 감지 시스템 (Optics) (1) 검출장치 : Photodiode (2) 열 노이즈를 줄여 최상의 감도를 얻을 수 있음 (3) 필터 세트 : 4개의 여기필터와 방출필터를 통한 형광감지 (4) 필터는 스펙트럼의 겹침이 없는 염료를 선택하여 사용한다면 염료구별에 효과적임. 연속적인 파장을 검출 하거나 강력한 multicomponenting algorithm을 가진 최적의 필터 세트로 매우 정확하게 염료를 구별할 수 있게 됨. 4) 여기 광원 : 고성능 Blue LED 5) 여기 필터 : 1 필터세트 6) 방출 필터 : 4 필터세트 7). 형광감지시스템의 교정 ① 이 시스템은 순수한 염료만을 측정하는 4개의 방출필터를 이용하여 같은 well에서 여러 형광 염료를 검출 할 수 있음 ② 이 시스템은 참고 형광 염료를 이용하여 실험시 생길 수 있는 파이펫팅에 의한 시료 의 양의 작은 차이까지도 보정할 수 있음 ③ 이 시스템은 정확한 감지 시스템 능력과 정교한 multi-componenting 알고리듬을 이용하여 매우 정확하고 재현성 있는 역치 cycle(Ct)을 보여주는 기하급수적 증가 구간의 데이터를 정확하게 관찰 할 수 있게 함 소프트웨어 1. 염기서열 검출 소프트웨어 (1) 복잡한 다중색상 또는 다중시료 실험을 쉽게 실험 할 수 있도록 Plate를 설정 (2) 증폭곡선의 실시간 감시 (3) 간편하게 데이터를 분석할 수 있는 자동 한계선과 자동역치 설정 (4) 기준 곡선을 이용한 목표 시료의 절대정량 (5) 그래픽을 통한 신뢰성 기준 값 지정으로 자동화된 SNP genotype calling (6) 간단한 해리곡선 데이터 수집 (7) 증폭곡선을 보면서 쉽게 시료well을 확인 2. 5' 탐침 디자인 소프트웨어 (1) TaqMan 탐침 및 프라이머 디자인: TaqMan PCR Kit를 이용한 fluorescent 5' nuclease assay분석에 이용될 적합한 Taq생명공학 분야: 유전자 발현 해석 SNP typing 유전자 검사를 통한 virus 검출 (Verotoxin gene 검사) 식품 0157 검� |
| 장비이미지코드 | http://nfec.ntis.go.kr/storage/images/equip/photo/201301/.thumb/Real Time PCR.JPG |
| 장비위치주소 | 충남 논산시 내동 건양대학교 26번지 건양대학교 산학협력관 1층 108호 |
| NFEC 등록번호 | NFEC-2013-02-175153 |
| 예약방법 | |
| 카타로그 URL | |
| 메뉴얼 URL | |
| 원문 URL | http://www.zeus.go.kr/equip/read?equipId=Z-NTIS-0037859 |
| 첨부파일 |
추가정보
| 과학기술표준분류 | |
|---|---|
| ICT 기술분류 | |
| 주제어 (키워드) |