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장비
장비 및 시설 기본정보
전문가용생물정보분석패키지
장비 개요
| 기관명 | ZEUS |
|---|---|
| 장비번호 | |
| 제작사 | CLC bio A/S |
| 모델명 | CLC Genomics Workbench |
| 장비사양 | |
| 취득일자 | 2011-10-19 |
| 취득금액 |
보유기관 및 이용정보
| 보유기관명 | 한경대학교 |
|---|---|
| 보유기관코드 | |
| 활용범위 | |
| 활용상태 | |
| 표준코드 | E202 |
| 표준분류명 | |
| 시설장비 설명 | CLC Genomics Workbench는 Next Generation Sequencing 데이터 등의 대용량 데이터를 어셈블리하고 분석할 수 있는 GUI 기반의 통합 솔루션입니다. 기존의 sanger 서열 데이터뿐만 아니라 GS-FLX Genome Analyzer SOLiD Helicos 및 Ion torrent 플랫폼의 분석이 가능하며 SIMD(Single Instruction Multiple Data) 기술을 통해 유전체 데이터 분석에 최상의 속도와 결과를 제공합니다.(1) Genomics De novo assembly 및 Reference assembly - Sanger 454 Illumina Genome Analyzer Helicos SOLiD 데이터 다른 dataset의 reference assembly Large scale의 mutation과 재배열을 위한 진보한 그래픽 tool genome assemble sequencing read quality data reference sequence를 확대 SNP 분석 및 보고서 (2) Transcriptomics mRNA sequence 데이터로부터 유전자 발현 프로파일 전체 chromosome 또는 genome에서의 exon mapping 및 비교 분석 유용한 유전자의 통계분석 Microarray와 sequencing(RNA-seq)을 기초한 발현 데이터 지원 Visualization(시각화): Heat map table scatter plot view Transformation과 normalization tool MA-와 boxplots으로 구성된 분석 Quality control tool 여러 그룹 비교를 위한 실험적인 디자인 tool 반복 측정 데이터를 위한 T-test와 ANOVA 분석 지원 정확한 p-value(Bonferroni and/or FDR) Clustering 알고리즘 - Hierarchical clustering K-mean과 Partitioning Around Medoids(PAM) NetAffx annotation array를 불러오기와 실험적 annotation 추가 기능 Gene set Enrichment Analysis(GSEA)와 Hyper-Geometric based test tool Expression Array와 RNA-seq 결과 비교 작업 능력 |
| 장비이미지코드 | http://nfec.ntis.go.kr/storage/images/equip/photo/201111/.thumb/20111111134512.jpg |
| 장비위치주소 | 경기도 안성시 석정동 67번지 한경대학교 |
| NFEC 등록번호 | NFEC-2011-11-150382 |
| 예약방법 | |
| 카타로그 URL | |
| 메뉴얼 URL | |
| 원문 URL | http://www.zeus.go.kr/equip/read?equipId=Z-NTIS-0030340 |
| 첨부파일 |
추가정보
| 과학기술표준분류 | |
|---|---|
| ICT 기술분류 | |
| 주제어 (키워드) |