| 시설장비 설명 |
1998년 설립된 Solexa는 SBS (Sequence by Synthesis)라는 새로운 기술을 시퀀싱에 적용하였고 2007년 일루미나는 Solexa를 합병한 후에 SBS 기반의 다양한 NGS 장비를 발전시켜 왔다. 현재의 대표적인 기종인 HiSeq 2000의 경우 2 x 100bp read에서 11일까지의 run time으로 최대 540-600Gb까지 데이터 생산이 가능한 것이 특징이다. 일루미나의 NGS 시리즈는 전반적으로 저렴한 run 가격으로 많은 데이터를 생산하는 특징을 추구해 왔으며 따라서 대용량의 시퀀싱을 대량으로 처리하는 연구에서 많이 사용되고 있다. 일루미나의 Hiseq2000 NGS 기법에서는 브릿지 증폭이라고 해서 슬라이드 위에 DNA 단편을 고정시킨 후에 최대 1000 분자까지 증폭시켜 같은 서열의 DNA 단편 집단을 형성시키는 게 특징인데 Hiseq2000은 이 집단을 클러스터 (cluster)라고 표현하며 이 클러스터를 주형으로 네 종류의 형광 표식 염기를 사용한 일 염기 합성반응인 SBS를 수행한다. Hiseq2000는 DNA 서열을 다른 기법들처럼 용액 안에서 증폭시키는 것이 아니라 판 위에 고정시킨 후에 판 위에서 구부러지면서 증폭되어 서열집단을 형성하는 것이 특징이다. 그렇게 형성된 클러스터라는 집단은 집단 별로 시퀀싱이 이루어져 각 read의 염기서열 정보로 전환되고 분석과정에 넘어간다. |
