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장비 및 시설 기본정보
NGS 데이터어셈블러패키지
장비 개요
| 기관명 | ZEUS |
|---|---|
| 장비번호 | |
| 제작사 | Clc Bio |
| 모델명 | Assembly Cell |
| 장비사양 | |
| 취득일자 | 2011-10-19 |
| 취득금액 |
보유기관 및 이용정보
| 보유기관명 | 한경대학교 |
|---|---|
| 보유기관코드 | |
| 활용범위 | |
| 활용상태 | |
| 표준코드 | E105 |
| 표준분류명 | |
| 시설장비 설명 | CLC Assembly Cell은 Next Generation Sequencing 데이터의 reference assembly와 de novo assembly를 위한 high-performance computing 솔루션입니다. Command-line 인터페이스를 지원하기 때문에 다른 Next Generation Sequencing 워크플로우와 스크립트를 쉽게 포함할 수 있습니다. 또한 SIMD 기술을 이용하여 병렬 형태의 assembly 알고리즘으로부터 빠른 속도의 분석을 진행할 수 있으며 현재의 Next Generation Sequencing assembler 분석 속도를 더욱 빠르게 향상시킬 수 있습니다.1) SIMD 기반의 HPC SIMD(Single Instrution Multiple Data)의 병렬 프로세스를 적용하여 대용량 염기서열 데이터의 고속 어셈블리 수행 가능 (2) ABI 454 Illumina Solid 동시 지원 다양한 플랫폼의 NGS 시퀀싱 데이터 어셈블 지원 ABI 454 Illumina Solid Helicos Ion torrent 플랫폼의 시퀀싱 데이터를 혼합한 어셈블 지원 (3) Reference assembly 분석 Illumina Genome Analyzer SOLiD 454 sequencing 데이터의 reference assembly Native color space assembly 지원 454/Titanium 데이터를 포함한 short read와 long read assembly Short read assembly를 위한 gap alignment 지원 Paired-end reads assembly 지원 (4) De novo assembly 분석 Illumina Genome Analyzer SOLiD 454 sequencing 데이터의 de novo assembly 454/Titanium 데이터를 포함한 short read와 long read assembly Paired-end 데이터의 de novo assembly 지원 |
| 장비이미지코드 | http://nfec.ntis.go.kr/storage/images/equip/photo/201111/.thumb/20111111114722.jpg |
| 장비위치주소 | 경기도 안성시 석정동 67번지 한경대학교 |
| NFEC 등록번호 | NFEC-2011-11-150376 |
| 예약방법 | |
| 카타로그 URL | |
| 메뉴얼 URL | |
| 원문 URL | http://www.zeus.go.kr/equip/read?equipId=Z-NTIS-0030334 |
| 첨부파일 |
추가정보
| 과학기술표준분류 | |
|---|---|
| ICT 기술분류 | |
| 주제어 (키워드) |